Hallo Stefan,
ja, das geht. Remote Buddy arbeitet mit sog. Behaviors. Diese werden auch automatisch aktiviert, wenn Du ein Programm startest. So kannst Du die Anwendungen steuern, ohne dass RB selbst zu sehen ist. Im jeweiligen Behavior kannst Du festlegen, welche Funktionen auf den Tasten der Fernbedienunge liegen. Einstellungen, die unter “Globale Belegung” eingerichtet sind, wirken in allen Behaviors und lassen sich dort im Einzelnen nicht mehr ändern.
Im Moment habe ich leider keinen Mac in der Nähe. Aber falls Du mir schreibst, welche Programme Du steuern möchtest, dann kann ich Dir später sicher weiterhelfen. Ich benutze RB zusammen mit Plex und EyeTV und bin sehr zufrieden.
lg
Michael
EDIT:
Hier steht schon etwas zu meiner Remote Buddy Konfiguration. Vielleicht hilft Dir das schon mal für den Anfang.