Hum… wie sieht’s denn mit der Systemlast aus? Mal den Systemmonitor nebenher laufen gelassen, und geschaut, ob irgendwas den Mac beschäftigt, wenn die Maus wieder ruckelt?
Im Zweifel ist das irgend ein blödes Plugin oder Programm, das man vor Urzeiten mal installiert und dann wieder vergessen hat. 